Πέντε χρόνια μετά τα κοσμοϊστορικά γεγονότα που έλαβαν χώρα κατά τη διάρκεια του XCOM 2, άνθρωποι, εξωγήινοι και ανθρωποεξωγήινοι, ζουν αρμονικά για συνεργάζονται για τη δημιουργία της τέλειας κοινωνίας. Όλοι; Όχι βέβαια, καθώς υπάρχουν διάφοροι πυρήνες που δεν βλέπουν με…